心理咨询师证书发放机构是专门负责管理和颁发心理咨询师资格证书的政府部门或社会组织，心理咨询师证书发放机构主要有以下几个：
1、中国心理卫生协会(CPA):中国心理卫生协会是一个全国性的专业性社会团体，成立于1952年，它是中国心理学界的权威组织，负责制定心理咨询师职业标准、培训课程和考试大纲，中国心理卫生协会设有心理咨询师专业委员会，负责组织和管理心理咨询师的考试、认证和发证工作。
2、各省、自治区、直辖市心理咨询师行业协会：各省、自治区、直辖市心理咨询师行业协会是地方性的心理卫生组织，它们通常与中国心理卫生协会保持密切合作，共同负责本地区心理咨询师的培训、考试和发证工作，这些协会通常会根据中国心理卫生协会的指导原则和要求，制定本地区的心理咨询师职业标准和考试大纲。
3、高校心理学专业教学单位：许多高校的心理学专业都设有心理咨询中心或心理健康教育中心，这些部门通常负责组织本校学生的心理咨询师培训和考试工作，在学生完成培训课程并通过考试后，由学校向中国心理卫生协会申请颁发心理咨询师资格证书。
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4、社会培训机构：一些专业的社会培训机构也会提供心理咨询师培训课程，并协助学员参加由中国心理卫生协会组织的考试，学员在完成培训并通过考试后，可以向培训机构申请颁发心理咨询师资格证书，但需要注意的是，这些证书的含金量可能不如由中国心理卫生协会颁发的证书。
心理咨询师证书发放机构主要由中国心理卫生协会、各省、自治区、直辖市心理咨询师行业协会、高校心理学专业教学单位和社会培训机构等组成，在选择心理咨询师培训机构时，建议选择具有良好声誉和教学质量的机构，以确保所获得的证书具有较高的认可度和市场价值，学员还需关注相关政策的变化，以便及时了解考证要求和流程。