心理咨询师证书发证机关是指负责颁发心理咨询师资格证书的政府部门或机构，心理咨询师证书发证机关主要是由国家卫生健康委员会(原卫生部)和人力资源和社会保障部共同管理的，这两个部门负责制定心理咨询师职业资格的考试大纲、考试标准和认证流程，对参加考试并合格的人员进行资格认定，颁发相应的心理咨询师资格证书。
国家卫生健康委员会作为主管全国卫生和健康工作的部门，负责制定和实施心理健康政策、法规和技术标准，推动心理健康事业的发展，在心理咨询师培训和认证方面，国家卫生健康委员会会同人力资源和社会保障部共同制定相关政策，组织实施心理咨询师职业资格鉴定工作。
人力资源和社会保障部作为负责人力资源社会保障工作的部门，负责制定和管理职业技能培训、职业技能鉴定、职业资格证书颁发等工作，在心理咨询师培训和认证方面，人力资源和社会保障部会同国家卫生健康委员会共同制定相关政策，组织实施心理咨询师职业资格鉴定工作。
心理咨询师证书发证机关的具体职责包括：
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1、制定心理咨询师职业资格的考试大纲、考试标准和认证流程，确保考试的公平、公正和专业性。
2、对参加心理咨询师职业资格考试并合格的人员进行资格认定，颁发相应的心理咨询师资格证书。
3、监督和管理心理咨询师培训和认证工作，确保培训质量和认证结果的有效性。
4、加强与国内外相关组织和机构的交流与合作，推动心理咨询师职业资格认证的国际化进程。
5、为心理咨询师提供政策法规、行业动态、培训信息等服务，帮助咨询师提高职业素养和业务能力。
6、受理公众对心理咨询师职业资格认证工作的投诉和建议，及时处理相关问题。
心理咨询师证书发证机关在心理咨询师培训和认证工作中起着关键作用，它的存在和运作有助于规范心理咨询行业的发展，保障广大咨询者的权益，提高心理咨询服务的专业水平。