心理咨询师证书的发放部门主要取决于你所在的具体地区，以及你选择的进修课程和培训机构，在许多地方，包括美国，颁发心理咨询师证书的主要机构是各州的医学委员会或专业组织。

在美国，每个州都有一个医学委员会或类似机构，负责管理和监督医疗专业人员的工作，这些委员会通常会有一个或多个认证委员会，负责颁发和管理各种专业证书，对于心理咨询师来说，这通常意味着你需要向该州的医学委员会或者相关的心理卫生专业组织申请证书。

情况可能会有所不同，中国的精神卫生法规定，从事精神卫生服务的单位和个人，应当经过专业培训并取得相应资质，中国的心理咨询师证书可能由各省、自治区、直辖市的精神卫生行政部门或者其他相关部门发放。

在选择进修课程和培训机构时，你应该仔细研究他们的背景和声誉，以确保他们能够提供高质量的教育和培训，你也应该查看他们的课程设置，了解他们是否提供了获得心理咨询师证书所需的所有必需课程和实习经验。

心理咨询师证书的发放部门取决于你所在的具体地区和你的个人选择，你应该花时间研究不同的选项，以找到最适合你的方案，无论你选择哪个部门发放你的证书，都要确保它是被广泛认可和接受的。