心理咨询师证书是由哪个部门颁发的，这是一个很常见的问题，心理咨询师证书主要由以下几个部门颁发：

1、中国心理卫生协会：中国心理卫生协会是一个专业性、学术性和群众性相结合的全国性社会团体，其宗旨是“促进心理卫生事业的发展，提高人民心理健康水平”，该协会负责组织和实施心理咨询师职业资格考试，并颁发相应的资格证书。

2、各省市心理学会：各省市心理学会是地方性的心理学术团体，其主要职责是推动本地区心理学的发展和普及，同时也承担着组织和实施心理咨询师职业资格考试的任务。

3、其他相关机构：除了上述两个主要的颁发机构外，还有一些其他的相关机构也会颁发心理咨询师证书，一些高等院校、职业培训机构、医疗卫生机构等都会开设相关的课程和培训项目，并颁发相应的证书。

需要注意的是，不同的颁发机构所颁发的证书可能存在一定的差异，在选择心理咨询师时，应该仔细查看证书上的颁发机构信息，并了解该机构的资质和信誉情况，还应该注意证书上的有效期和认证范围等内容，以确保所获得的证书具有合法性和有效性。