南阳厨师证的发放部门主要有两个，分别是南阳市人力资源和社会保障局和南阳市餐饮行业协会，这两个部门都是经过政府批准设立的，具有一定的权威性，哪个部门发放的好些，需要从以下几个方面进行综合考虑。

我们需要了解南阳厨师证的发放标准和要求，根据《中华人民共和国职业资格证书条例》，职业资格证书分为初级、中级、高级三个等级，其中厨师职业资格证书分为初级、中级、高级三个等级，而南阳厨师证的发放标准和要求则由南阳市人力资源和社会保障局制定并实施，我们可以从这个角度来判断哪个部门更加专业和权威。

我们需要了解南阳厨师证的考试难度和通过率，考试难度越大，通过率越低的部门更加注重考生的专业能力和技能水平，我们可以通过查询南阳市人力资源和社会保障局和南阳市餐饮行业协会发布的考试信息来了解这一点。

我们还需要考虑南阳厨师证的实际应用价值和就业前景，一个好的职业资格证书不仅能够提高个人的职业技能水平，还能够为个人的职业发展提供更多的机会和选择，我们可以通过查询南阳市人力资源和社会保障局和南阳市餐饮行业协会发布的就业信息来了解南阳厨师证的实际应用价值和就业前景。

南阳市人力资源和社会保障局和南阳市餐饮行业协会都是比较正规和权威的南阳厨师证发放部门，具体哪个部门发放的好些还需要根据以上几个方面的综合考虑来进行判断。