在填写高级农艺师证书发证机关时，需要根据实际情况选择相应的单位或部门，高级农艺师证书的发证机关可以包括以下几种类型：

1. 农业部门：农业部门是负责管理和监督农业生产的政府机构，通常具有颁发农业相关证书的权力，国家农业部门、省农业厅、市农业局等，如果您是在农业部门从事高级农艺师工作的人员，那么您的发证机关应该是该部门。

2. 农业大学或农业职业学院：农业大学和农业职业学院是专门培养农业人才的教育机构，也是高级农艺师培训和考核的重要场所，如果您是在这些学校接受高级农艺师培训并通过考试的人员，那么您的发证机关应该是这些学校。

3. 农业企业或合作社：一些农业企业和合作社也会开展高级农艺师培训和认证工作，为相关人员颁发高级农艺师证书，如果您是在这些企业或合作社从事高级农艺师工作的人员，那么您的发证机关应该是这些企业或合作社。

无论您选择哪种类型的发证机关，都需要确保所填写的信息准确无误，还需要注意以下几点：

1. 根据实际情况选择发证机关：不同地区、不同行业、不同单位的高级农艺师证书发证机关可能会有所不同，您需要根据自己的实际情况选择相应的发证机关。

2. 注意证书的有效期限：高级农艺师证书通常有一定的有效期限，您需要在填写发证机关时注意证书的有效期，以免过期无法继续使用。

填写高级农艺师证书发证机关时需要仔细核对相关信息，确保填写正确无误，也需要根据自己的实际情况选择合适的发证机关，以便顺利获得高级农艺师证书。