农艺师证是由国家相关部门颁发的专业资格证书，主要目的是对从事农业技术的专业人员进行资格认定和技能评价，农艺师证的颁发主要由以下几个部门负责：
1、农业农村部：农业农村部是中国农业和农村工作的最高行政机构，负责全国农业和农村工作的领导和管理，农业农村部颁发的农艺师证具有最高的权威性和公信力，是农艺师职业发展的重要依据。
2、省级农业厅（局）：各省、自治区、直辖市的农业厅（局）负责本行政区域内的农业和农村工作，省级农业厅（局）颁发的农艺师证在本地区具有一定的认可度和影响力，对于农艺师在本省范围内的职业发展具有重要意义。
3、地市级农业局（委）：地市级农业局（委）负责本行政区域内的农业和农村工作，地市级农业局（委）颁发的农艺师证在本地区具有一定的认可度和影响力，对于农艺师在本地区范围内的职业发展具有重要意义。
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4、农业科研院所：农业科研院所是农业科技研究和技术服务的重要基地，对于农艺师的技能培训和职业发展具有重要作用，农业科研院所颁发的农艺师证在农业科技领域具有一定的认可度和影响力。
5、农业职业技术学院：农业职业技术学院是培养农业技术人才的重要基地，对于农艺师的技能培训和职业发展具有重要作用，农业职业技术学院颁发的农艺师证在农业职业教育领域具有一定的认可度和影响力。
农艺师证哪个部门颁发的好，需要根据个人的职业发展需求和所在地区的实际情况来综合考虑，农业农村部颁发的农艺师证具有最高的权威性和公信力，是农艺师职业发展的首选，在实际操作中，省级、地市级、农业科研院所和农业职业技术学院颁发的农艺师证也具有一定的认可度和影响力，可以作为农艺师职业发展的有力补充。